ObsidianとiCloudの同期設定！iPhoneやWindowsの注意点

ObsidianとiCloudの同期が遅いと感じたり、WindowsやiPhoneでうまく同期できないトラブルに悩んでいませんか？無料で使えるiCloudは便利ですが、実は設定方法やOSごとの相性によって、ファイルが消えたり重複したりするリスクが潜んでいます。私自身も最初は手軽さから始めましたが、仕組みを理解しないまま使うと痛い目を見ることになります。この記事では、システムエンジニアリングの観点から分析された情報を元に、ObsidianとiCloudを安全かつ快適に使うための具体的な設定と、避けるべき運用方法について解説します。

• ObsidianとiCloudを同期させる際の正しい設定手順
• 同期が遅い問題を解決する「Keep Downloaded」機能
• Windows環境でiCloud同期を使ってはいけない理由
• 大切なデータを守るためのバックアップと設定分離

ObsidianとiCloudの同期における基本設計

Obsidianのデータを同期する方法はいくつかありますが、Apple製品を中心に生活しているユーザーにとって、OS標準機能であるiCloud Driveは最も手軽で魅力的な選択肢です。しかし、Obsidianは一般的なメモアプリとは異なり、ローカルにある大量のテキストファイル（Markdown）を直接読み書きするという特殊なアーキテクチャを持っています。そのため、写真やPDFを保存する感覚でiCloudを使うと、予期せぬ同期エラーやパフォーマンスの低下に直面することになります。まずは、ObsidianとiCloudを組み合わせる際の大前提となる「絶対に失敗しないための初期設定」や、Apple製品同士での最適な運用フローについて、技術的な背景も交えながら詳しく解説します。ここを間違えると「起動しない」「同期が終わらない」といったトラブルの元になります。

ObsidianのiCloud同期を設定する手順

これから新しくObsidianを使い始める場合、あるいはローカルで運用していたVault（保管庫）をiCloudへ移行する場合、その手順には明確な「正解」があります。最もトラブルが少なく、システムの安定性を保てる導入フローは、iPhoneやiPadなどのiOSデバイスから保管庫を作成する方法です。

なぜPC（Mac）から作成してはいけないのでしょうか？それは、iOSというOSが持つ強力なセキュリティ機構「サンドボックス」が関係しています。iOSアプリは、それぞれが自分専用の「箱」の中で動作しており、他のアプリのデータやシステム領域へ勝手にアクセスできないよう厳重に管理されています。PCで適当なフォルダ（例えば「Documents」の中など）にVaultを作成し、それを無理やりiCloudで同期させようとすると、iOS側のObsidianアプリがそのフォルダへのアクセス権限を正しく取得できず、同期エラーやファイルの読み込み不可を引き起こす原因となります。

iOSデバイスでの作成手順

具体的な手順は非常にシンプルですが、以下のステップを確実に踏むことが重要です。

1. まず、iPhoneまたはiPad版のObsidianアプリをインストールして起動します。
2. 「Create new vault（新しい保管庫を作成）」を選択します。
3. Vault名を入力する画面で、「Store in iCloud（iCloudに保存）」というトグルスイッチが表示されるので、これを必ずオンにします。
4. 「Create」ボタンを押して完了です。

この手順を踏むことで、iCloud Driveのルートディレクトリ、またはアプリ専用のコンテナ内に、iOSが「Obsidian用のフォルダだ」と認識できる正しい権限を持ったフォルダが自動生成されます。これにより、将来的なアクセストラブルを未然に防ぐことができます。

Macでの同期確認と接続

iOS側で作成が完了したら、Mac側でそのフォルダを認識させます。MacのFinderを開き、サイドバーにある「iCloud Drive」を選択してください。少し待つと、自動生成された「Obsidian」というロゴ付きのフォルダ（または指定した名前のフォルダ）が表示されるはずです。

iPhoneでObsidianを使う際の注意点

iPhoneやiPadでObsidianを使っていると、アプリを起動した瞬間に「Waiting for iCloud to synchronize...（iCloudの同期を待機中）」というメッセージが表示され、画面が固まって一切の操作ができなくなる現象に遭遇することがあります。急いでメモを取りたい時にこれが起きると、非常にストレスが溜まりますよね。

なぜ「待機中」で止まってしまうのか

この現象の根本的な原因は、Obsidianの起動に必要な「設定ファイル」が、iPhone本体のストレージに存在せず、iCloud上にしか存在しない状態（オフロード状態）になっていることにあります。Obsidianは起動時に、プラグインのリストや画面のレイアウト情報、テーマ設定など、多数の小さな構成ファイルを読み込もうとします。しかし、iOSが「最近使っていないから」と判断してこれらのファイルを勝手にクラウドへ退避させてしまっていると、Obsidianは起動処理を中断してファイルのダウンロードを待つしかありません。

モバイル通信環境での落とし穴

さらに状況を悪化させるのが、モバイルデータ通信の設定です。iPhoneの設定で「iCloud Drive」へのモバイル通信がオフになっていると、Wi-Fiがない環境ではいつまで経っても設定ファイルがダウンロードされず、Obsidianは永遠に起動画面でスタックしてしまいます。

特に、コミュニティプラグインを数十個も入れているような「ヘビーな環境」では、読み込むべきファイルの数が膨大になるため、この問題が顕著に現れます。このストレスを根本から解消するには、次に解説する「Keep Downloaded」の設定が必須となります。

ObsidianのiCloud同期が遅い時の対策

「同期が終わらない」「Macで書いたメモがiPhoneに表示されるまで10分以上かかる」。こうした同期の遅さは、iCloudの「ストレージを最適化（Optimize Storage）」という機能が、Obsidianの運用においては完全に裏目に出ていることが最大の要因です。

「ストレージを最適化」の弊害

Appleのエコシステムには、デバイスの空き容量を確保するために、使用頻度の低いローカルファイルを自動的に削除し、クラウド上の実体への参照情報（クラウドアイコンがついたプレースホルダー）のみを残す機能があります。ドキュメント編集アプリ（WordやPages）であれば、ファイルを開く瞬間にダウンロードすれば問題ありません。

しかし、Obsidianは「ローカルファースト」のツールです。Vaultを開く際、全ファイルのインデックスを作成するために、すべてのファイルにアクセスしようとします。この時、ファイルの実体がなく、いちいちiCloudからダウンロードしなければならない状態だと、OSに対して数百〜数千のダウンロードリクエストが一斉に発生します。これが「同期遅延」の正体です。

救世主となる新機能「Keep Downloaded」

長年、Obsidianユーザーはこの仕様に苦しめられてきましたが、macOS Sequoia (15) および iOS 18以降において、ついに解決策が実装されました。それが「Keep Downloaded（ダウンロード済みにする）」機能です。

これは、iCloud全体の「ストレージを最適化」設定がオンになっていても、ユーザーが指定した特定のフォルダだけは例外として扱い、常にローカルデバイス上にファイルの実体を保持し続けるよう強制する機能です。

設定手順と効果

設定は非常に簡単です。以下の手順をMacとiPhoneの両方で行ってください。

• Macの場合: Finderで iCloud Drive を開き、Obsidianのフォルダを右クリック（またはControlクリック）します。メニューから「Keep Downloaded（ダウンロード済みにする）」を選択します。フォルダ名の横から雲のアイコンが消え、実体があることを示すアイコンに変われば成功です。
• iPhone/iPadの場合: 純正の「ファイル」アプリを開き、iCloud Drive内のObsidianフォルダを長押しします。表示されるメニューから「Keep Downloaded（ダウンロード済みにする）」を選択します。

この設定を行うことで、Obsidian起動時のインデックス作成においてファイルのダウンロード待ちが発生しなくなり、起動速度が劇的に向上します。また、電波の入らない機内や地下鉄などのオフライン環境下でも、確実にノートにアクセスできるようになります。（出典：Apple『MacでiCloud Driveのフォルダやファイルを操作する』）

iCloudドライブでの保管庫作成のポイント

iCloud Drive上でObsidianのVaultを運用する場合、フォルダの階層構造や配置場所にも「作法」があります。ここを適当にしてしまうと、将来的なデータ移行やバックアップの際に無用なトラブルを招くことになります。

ルート直下での管理を推奨

保管庫を作成する場所は、iCloud Driveのルート（一番上の階層）直下、もしくはObsidianアプリが自動生成した専用フォルダを使用するのが鉄則です。「ドキュメント」フォルダの中に「仕事用」フォルダを作り、さらにその中に「メモ」フォルダを作って…といった深い階層の中にVaultを置くことは推奨されません。

パス（ファイルの住所）が長くなりすぎると、一部のプラグインやOSの処理でエラーが発生する可能性があるほか、iOSのファイルアプリでのブラウジングも煩雑になります。ObsidianのVaultは、それ自体がひとつの「データベース」のようなものです。システム的に独立した扱いやすい場所に配置しましょう。

隠しフォルダ「.obsidian」の役割

ObsidianのVaultフォルダの中には、.obsidian という名前の隠しフォルダが必ず存在します。ここには、テーマ、プラグイン、ホットキー設定、ワークスペースの配置など、あなたのObsidian環境の全てが詰まっています。iCloud同期を行う際、この隠しフォルダも自動的に同期されますが、ユーザーが手動でこの中身をいじることは基本的にはありません。

Obsidianの設定ファイルを分離するメリット

MacとiPhoneで同じ保管庫を同期して使う場合、全てのデータを同期するのが理想とは限りません。特に設定フォルダ（.obsidian）に関しては、デバイスごとに分離して管理する方が、遥かに快適で安定した環境を作ることができます。

なぜ設定を分ける必要があるのか

PC（Mac）とスマートフォン（iPhone）では、画面のサイズ、CPUの処理能力、操作体系（キーボード対タッチパネル）が全く異なります。にもかかわらず、全く同じ設定ファイルを共有してしまうと、以下のような弊害が発生します。

• プラグインの負荷: Macでは便利な「Dataview」や重厚なテーマも、iPhoneでは動作を重くするだけの原因になります。
• 画面レイアウトの崩壊: Macで広々とウィンドウを分割して作業した後、その配置情報（workspace.json）が同期されると、次にiPhoneで開いた時に小さな画面が分割されすぎて操作不能になることがあります。
• 操作性の不一致: モバイル専用のツールバー設定や、PC専用のショートカットキー設定が混ざり合い、使い勝手が悪くなります。

「Override config folder」の実装手順

Obsidianには、この問題を解決するための機能が標準で備わっています。「Override config folder（設定フォルダを上書き）」という機能を使って、モバイル専用の設定フォルダを作ってみましょう。

これで、iPhoneは .mobile フォルダの設定を読み込み、Macは .obsidian フォルダの設定を読み込むようになります。データ（ノートの中身）は共有しつつ、テーマやプラグインの有効/無効はデバイスごとに自由に設定できる、理想的な環境の完成です。

WindowsでObsidianとiCloudを使うリスク

ここからは少しシビアな話になりますが、Windows環境でiCloud同期（iCloud for Windows）を利用することは推奨されません。「会社がWindowsでスマホがiPhoneだから」という理由でこの組み合わせを選ぼうとしている方は、今一度立ち止まって考えてみてください。公式コミュニティや多くのヘビーユーザーからも、データの破損や消失のリスクが繰り返し警告されています。

Windows版iCloudで同期できない原因

なぜWindowsとiCloudの相性はこれほどまでに悪いのでしょうか。その原因は、OSのファイルシステム（NTFS）とiCloudの同期ロジックの間に、埋めがたい構造的な不適合が存在するからです。

プレースホルダー機能との衝突

Windows版のiCloudは、Macと同様にファイルを「プレースホルダー（実体のないアイコン）」として表示し、ユーザーがそのファイルを開こうとした瞬間にサーバーからダウンロードする方式を採用しています。WordやExcelのような通常のファイル操作であれば、これはうまく機能します。

しかし、Obsidianの動作原理は特殊です。起動時に数千個のファイルを一気にバックグラウンドでスキャンし、リンク構造やタグのインデックスを作成しようとします。この時、Obsidianが猛烈な勢いでファイルアクセスを行うのに対し、iCloud for Windows側のダウンロード処理が全く追いつかない事態が発生します。結果として、Obsidianは「ファイルが存在しない」あるいは「読み込み不可」と誤認してインデックスエラーを起こしたり、最悪の場合、ファイルの中身を0バイト（空っぽ）で上書きしてしまうという恐ろしいトラブルが発生しやすくなります。

競合ファイルが発生するメカニズムと回避策

さらに厄介なのが、ファイルの「競合（Conflict）」です。Obsidianには入力中に数秒おきに自動保存を行う機能がありますが、iCloudもファイルの変更を検知すると即座にアップロードを開始し、その間ファイルをロック（書き込み禁止）することがあります。

無限に増殖する「(1).md」の恐怖

Windows環境では、この「自動保存」と「同期アップロード」のタイミングがかち合いやすく、デッドロックが発生します。Obsidianが保存しようとしたらiCloudがロックしており保存に失敗、あるいはiCloud側が「外部で変更された」と誤認し、データの整合性を保つために別名のファイルを生成します。

Obsidianデータの安全なバックアップ方法

iCloudなどの同期サービスを使っていると「クラウドにデータがあるからバックアップは不要」と勘違いしがちですが、これは大きな間違いです。同期サービスは、「誤った削除」や「ファイルの破損」も、忠実に全てのデバイスに瞬時に反映させてしまうからです。同期はバックアップではありません。

3-2-1ルールの適用

データの安全性を確保するための基本原則「3-2-1ルール」をObsidian運用にも適用しましょう。

• 3つのデータを持つ: オリジナルデータ + 2つのコピー。
• 2種類の異なるメディアで保存: PCのHDDと、クラウドストレージなど。
• 1つはオフサイト（遠隔地）に: 災害などに備えて。

具体的なバックアップ手段

Obsidianユーザーに強く推奨されるバックアップ手段は以下の通りです。

1. Local Backupプラグイン: 定期的（例：起動時や1時間ごと）にVault全体のZipアーカイブを作成し、iCloud以外の場所（Google DriveフォルダやローカルHDD）に自動保存してくれるプラグインです。設定が簡単で、万が一の時に「昨日の状態」へ丸ごと戻せる安心感があります。
2. Obsidian Gitプラグイン: 技術的な敷居は高いですが、変更履歴を完全に管理できる最強のツールです。iCloudがファイルを消失させても、GitHub上のリポジトリには履歴が残るため、そこから確実に復旧できます。
3. Time Machine (Mac): Macユーザーであれば、Time Machineバックアップも有効です。「Keep Downloaded」設定をしておけば、Time MachineはiCloud上のファイルもバックアップ対象としてくれます。

同期エラーを防ぐための代替手段の検討

もしあなたがWindowsとiPhoneを併用していて、iCloudでの同期トラブルに日々ストレスを感じているなら、無料のiCloudに固執するのをやめ、他の手段への乗り換えを検討すべき時期かもしれません。快適なObsidianライフを送るための代替案を比較してみましょう。

※Remotely Save自体は無料ですが、保存先（S3など）に少額のコストがかかる場合があります。

結論：どれを選ぶべきか

最も推奨されるのは、公式のObsidian Sync（月額4ドル〜）です。お金はかかりますが、同期トラブル解決にかかる時間とストレスをお金で買うと考えれば、決して高くはありません。エンドツーエンドの暗号化やバージョン履歴の保持など、セキュリティ面でも最強です。

コストを抑えたい技術指向の方は、「Remotely Save」プラグインを導入し、Amazon S3互換ストレージやOneDrive経由で同期する方法もあります。これにより、iCloudの不安定さから解放され、Windowsでも安定した同期が可能になります。

ObsidianとiCloudの統合運用のまとめ

今回はObsidianとiCloudの同期について、その仕組みからトラブル対策まで徹底的に解説しました。結論として、Apple製品（Mac, iPhone, iPad）だけで固めているユーザーにとっては、今回紹介した「Keep Downloaded」の設定や、設定フォルダの分離（.mobile）を正しく行うことで、無料で十分に快適かつ高速な環境が構築できます。

一方で、Windowsユーザーにとっては、残念ながらiCloud同期は「茨の道」です。大切な思考のログやアイデアを失わないためにも、自分の利用環境に合った同期方法を賢く選び、必ず同期とは別のバックアップを取るようにしてください。この記事が、あなたのObsidianライフをより安全で快適なものにする一助となれば幸いです。